Covid-19 : Chasse aux virus dans les eaux usées

Christiane Fux a étudié le journalisme et la psychologie à Hambourg. Le rédacteur médical expérimenté rédige des articles de magazines, des actualités et des textes factuels sur tous les sujets de santé imaginables depuis 2001. En plus de son travail pour, Christiane Fux est également active dans la prose. Son premier roman policier a été publié en 2012, et elle écrit, conçoit et publie également ses propres pièces de théâtre policières.

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L'idée semble impressionnante car elle semble si simple : étant donné que les coronavirus sont également excrétés par les intestins, des échantillons d'eaux usées peuvent être utilisés pour déterminer où le processus d'infection reprend de la vitesse.

Avec des échantillons de 900 stations d'épuration, les experts souhaitent surveiller l'activité du Sars-CoV-2 dans toute l'Allemagne. Vérifiés et analysés chaque semaine, les foyers d'infection inflammatoires ont pu être identifiés rapidement.

Système d'alerte précoce contre le corona

« En théorie, il serait même possible de le limiter à certaines parties de la ville ou même des rues », explique le Dr. René Kallies en conversation avec Le virologue du Centre Helmholtz pour la recherche environnementale (UFZ) à Leipzig travaille sur le projet avec des collègues de l'Association allemande pour la gestion de l'eau, des eaux usées et des déchets (DWA) et la TU Dresden. Les scientifiques commenceront ce mois-ci un essai dans 20 stations d'épuration allemandes.

L'objectif est, par exemple, de pouvoir évaluer si les régions restent réellement en dessous de la valeur guide fixée par les politiciens d'un maximum actuellement de 50 nouvelles infections pour 100 000 habitants.

Les chercheurs sont actuellement en train d'examiner des échantillons d'eaux usées différés et de les comparer avec le nombre de cas signalés à ce stade. Cela leur donne une idée approximative des quantités de particules virales qui se retrouvent dans les eaux usées lorsqu'un certain nombre de personnes sont infectées.

Mais cela peut donner des résultats très différents : le nombre de cas non signalés, c'est-à-dire le nombre de cas non détectés, est susceptible de varier considérablement d'une région à l'autre. Parce que cela dépend du nombre de personnes qui ont été testées pour l'infection virale.

Calculs de modèle délicats

Cependant, il est difficile de le calculer aussi précisément que possible, car la quantité de virus excrétée varie considérablement d'une personne à l'autre. Cela dépend, entre autres, de la force du système immunitaire ou du stade de l'infection.

« Nous n'avons toujours pas les données pour calculer une moyenne solide », explique Kallies. Puisque la recherche rapporte actuellement de nouvelles informations sur le coronavirus au quotidien, il est néanmoins confiant que des chiffres fiables seront bientôt disponibles que les mathématiciens de l'équipe pourront utiliser pour construire leur modèle de calcul.

De plus, on sait déjà que le virus est excrété plus longtemps que la personne infectée n'est malade ou contagieuse. "Cela se refléterait alors également dans les échantillons", explique le virologue. Il y a donc un autre facteur qui doit être pris en compte dans le modèle.

A la recherche des meilleures pratiques

Il n'est pas encore clair non plus quelle procédure sera utilisée. Vous devez d'abord préparer l'échantillon afin de pouvoir le tester pour le virus. La méthode la plus simple, à savoir travailler avec la lyophilisation, prend trois jours. « C'est trop long », dit le scientifique. De plus, il est trop imprécis.

Le virologue s'appuie actuellement sur la précipitation au polyéthylène glycol - un processus dans lequel les échantillons d'eaux usées sont d'abord mélangés avec un agent qui se lie aux virus puis précipite. L'agent et les virus sont ensuite séparés des autres composants par une centrifugeuse haute performance. "Cela laisse quelques gouttes concentrées d'une grande tasse de café d'eaux usées." En fin de journée, le matériel génétique du virus est détecté à l'aide d'un test PCR.

L'objectif est d'obtenir la fiabilité la plus élevée possible des tests avec le moins d'effort possible, ce qui fonctionne également de manière fiable avec un faible nombre de cas.

Qu'est-ce qui est vraiment important dans la station d'épuration?

D'autres variables découlent des différents équipements des stations d'épuration et des réseaux d'égouts. Ils ont des longueurs et des diamètres différents. « Nous devons encore vérifier quelles particules restent bloquées sur le chemin », explique Kallies. Même le temps joue un rôle : « Lorsqu'il fait sec, il arrive moins à la station d'épuration que lorsqu'il pleut. Mais nous espérons que nous pourrons modéliser cela. »

Si le processus fait ses preuves, de plus grandes stations d'épuration, qui vérifient régulièrement elles-mêmes les eaux usées, pourraient également tester le Sars-CoV-2. Les plus petits devraient envoyer les échantillons au laboratoire. Ces données seraient ensuite fusionnées et évaluées dans un bureau central de notification. "Dans une certaine mesure, une sorte de RKI pour les eaux usées", explique le chercheur.

Répondre rapidement aux épidémies

L'idée derrière le projet : en cas d'épidémie majeure, la détection précoce permet de prendre des mesures de confinement plus rapides, comme des tests plus intensifs sur la population.

Si la méthode de découverte de l'activité Sars-CoV-2 dans une région s'avère fiable, la procédure pourrait être déployée rapidement à l'échelle nationale. "Nous nous sommes fixé l'objectif de l'automne, et ce n'est pas irréaliste non plus." Ce serait bien avant la prochaine saison grippale, qui pèsera sur le système de santé en plus des malades du Covid-19. Kallies déclare : « Nous y travaillons tous avec passion. »

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